손가락 굵기의 가늘고 유연한 튜브를 항문을 통해 삽입하여 대장의 이상 소견을 관찰하는 것입니다. 대장내시경은 렌즈와 조명이 있어 검사자가 비디오를 통해 관찰할 수 있습니다. 

대장암의 선별검사로서 추천됩니다. 대장암은 국내에서 세 번째 빈도로 발생하는 암종으로 발생률이 증가하고 있으며, 아시아에서 대장암 발생률 1위를 차지하고 있습니다. 선별검사로도 대장내시경은 암 발생률을 감소시키는 것으로 증명되었습니다. 또한, 출혈이나 만성 설사와 같은 증상이 있을 경우 대장내시경이 필요합니다.

검사 전날 유동식으로 제한하며 검사 전 처방받은 장 정결제를 복용하게 됩니다. 완벽한 검사를 위해서는 대장정결이 중요하므로 식사와 정결제 복용 등 지시를 숙지해야 합니다. 

대부분의 약은 복용해도 됩니다. 그러나, 아스피린, 항혈소판 제제, 항응고 제제, 인슐린 등은 미리 알려주어 검사자가 참조 혹은 조절해야 합니다. 특정 약제에 대한 알레르기 유무도 알려주십시오.   

대부분의 약제를 복용해도 되나, 장정결이나 검사를 방해할 수 있는 몇몇의 약제가 있습니다. 진료 시 복용하고 있는 약, 특히 아스피린, 관절염 약, 항응고제 (와파린이나 헤파린), 항혈소판제 (클로피도그렐), 인슐린이나 철분제 등은 의사에게 알려주십시오. 또한, 알레르기가 있는 약제에 대해 상의하십시오.

검사 중 압박감, 팽만감 혹은 경련성 통증을 느낄 수 있으나 매우 심한 통증은 드뭅니다. 선택에 따라 불편감을 줄이기 위해 진정유도제나 진통제를 처방하게 됩니다. 검사자가 내시경을 진입하는 동안 좌측 혹은 위를 보고 누워있게 됩니다. 검사자는 내시경을 후퇴하면서 자세히 관찰합니다. 검사시간은 10-20분 정도이나 용종제거 등을 하게 되면 더 소요될 수 있습니다.

검사자가 필요하다고 생각하면 내시경의 겸자공을 통해 조직검사용 겸자를 통과시켜 작은 조직을 체취하여 검사합니다. 출혈을 발견한 경우에는 출혈점에 대해 약제를 주입하고나, 전기소작을 하거나, 클립을 통한 기계적 지혈술을 시행합니다. 용종이 발견되면 검사 중 제거합니다.  대장암은 용종에서 발생하게 되므로 용종제거는 대장암을 예방하는데 중요한 시술입니다. 

작은 용종의 경우 조직겸자로 뜯어내거나, 크기가 큰 경우 올가미를 이용한 용종제거술로 제거하게 됩니다. 용종절제술은 겸자공을 통해 올가미를 삽입하여 병변을 포획한 후 전류를 이용하여 절제하는 방법입니다. 시술 중 통증은 없습니다. 

진정유도제를 사용했다면 회복할 때까지 휴식하게 됩니다. 검사 중 공기를 주입하기 때문에 팽만감이나 경련성 통증을 느낄 수 있습니다. 방귀를 뀌면서 불편감은 사라지게 됩니다.  조직 검사 결과는 수일의 결과가 소요되지만 육안적 소견에 대해서는 검사 후에 바로 설명을 듣게 됩니다. 진정유도하 내시경 검사를 받았다면 판단과 반사반응이 저하되므로 운전을 하거나 중요한 결정은 하지 않아야겠습니다. 검사 후 식사는 할 수 있으나 용종절제술 등을 시행하였을 경우 식이제한을 할 수 있습니다. 

대장내시경과 용종절제술은 수련 받고 경험이 있는 검사자에 의해 시행될 때 일반적으로 안전합니다. 가능한 합병증은 장천공이고 이는 수술을 필요로 합니다. 그러나, 검사 중 발견되고 클립을 통해 봉합하였을 때는 입원하여 금식/항생제 치료만으로 대부분 회복합니다. 조직검사/용종절제술 자리에서 출혈할 수 있습니다. 저절로 멈추는 경우도 있으며 지속될 경우 내시경을 통해 지혈할 수 있습니다. 심혈관질환이 있는 환자의 경우 진정 유도제에 의한 합병증이 있을 수 있습니다. 검사자의 관찰하에 진정유도제의 투여가 필요합니다. 복통, 발열, 직장출혈이 있을 경우 주치의과 상의하십시오. 출혈은 시술 후 수일 후에도 발생할 수 있습니다.